ATCC的U87MG細(xì)胞系搞”錯“了？
瑞典Uppsala大學(xué)的研究人員利用短串聯(lián)重復(fù)序列（STR）基因分型和基于芯片的基因表達(dá)譜技術(shù)，比較了ATCC的U87MG細(xì)胞系和Uppsala大學(xué)的U87MG細(xì)胞系，以及約五十年前用來開發(fā)該細(xì)胞系時使用的腫瘤樣本。它表明，ATCC的U87MG細(xì)胞系不是神經(jīng)膠質(zhì)瘤，而更接近于之前分析過的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤樣本。這項研究結(jié)果近日在線發(fā)表在《Science Translational Medicine》上。
文章通訊作者、Uppsala大學(xué)免疫學(xué)、遺傳學(xué)和病理學(xué)研究者BengtWestermark表示，“Uppsala大學(xué)的細(xì)胞系與原始腫瘤的基因相同，但是ATCC的U87MG細(xì)胞系的來源不明。我們不知道在這五十年間的哪個時間點發(fā)生了細(xì)胞系的混淆，ATCC的U87MG細(xì)胞系極有可能來自另一例人類神經(jīng)膠質(zhì)瘤。”
ATCC的U87MG細(xì)胞系可能是人類膠質(zhì)母細(xì)胞瘤
細(xì)胞系的誤認(rèn)和污染日益成為醫(yī)學(xué)研究中的問題，這促使Nature、美國癌癥研究學(xué)會（AACR）和其他出版者引入指南，要求研究人員利用DNA分析技術(shù)認(rèn)證已發(fā)表研究中使用的細(xì)胞系。
Westermark和他的同事們對原始U87MG細(xì)胞系很熟悉，它是60年代在Uppsala大學(xué)建立的，他們擔(dān)心ATCC的U87MG細(xì)胞系的真?zhèn)巍Ｓ捎赨ppsala大學(xué)仍保存有生成該細(xì)胞系的原始神經(jīng)膠質(zhì)瘤腫瘤樣本，研究小組能夠直接將來自Uppsala大學(xué)和ATCC的U87MG神經(jīng)膠質(zhì)瘤細(xì)胞系與原始腫瘤的基因和轉(zhuǎn)錄模式進(jìn)行比較。
研究人員通過16個短串聯(lián)重復(fù)標(biāo)記物(STR標(biāo)記)對來自ATCC和Uppsala大學(xué)的U87MG細(xì)胞系進(jìn)行基因分型研究，他們發(fā)現(xiàn)這兩個U87MG細(xì)胞系有12個短串聯(lián)重復(fù)標(biāo)記物存在差異。研究人員進(jìn)一步將研究范圍擴(kuò)大到Uppsala大學(xué)的另外19個人類神經(jīng)膠質(zhì)瘤細(xì)胞系，發(fā)現(xiàn)了兩個基因上完全相同的細(xì)胞系，這種情況似乎是由污染引起的。雖然U87MG細(xì)胞系與其他神經(jīng)膠質(zhì)瘤細(xì)胞系相似，但來自ATCC的版本仍然存在不同，研究小組通過線粒體DNA檢測和基于芯片的表達(dá)譜分析證明了這種差異。后者的分析結(jié)果表明，ATCC的U87MG細(xì)胞系似乎是人類膠質(zhì)母細(xì)胞瘤。
根據(jù)這些發(fā)現(xiàn)，研究人員建議使用STR基因分型驗證過的神經(jīng)膠質(zhì)瘤細(xì)胞系，例如Human Glioma Cell Culture資源。Westermark等作者寫道，“我們建議在大腦腫瘤生物學(xué)研究中使用這些或類似的神經(jīng)膠質(zhì)瘤細(xì)胞系。研究人員應(yīng)該在研究培養(yǎng)的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤細(xì)胞時，使用這類細(xì)胞系作為參考，使用驗證過的細(xì)胞系替換U87MG和其他經(jīng)典細(xì)胞系。”
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參考文獻(xiàn)：Origin of the U87MG glioma cell line: Good news and bad news. Science Translational Medicine, DOI:10.1126/scitranslmed.aaf6853
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