細(xì)胞STR分型介紹
短串聯(lián)重復(fù)序列（shorttandemrepeat,STR）是核心序列為2-6個(gè)堿基的短串聯(lián)重復(fù)結(jié)構(gòu)。20世紀(jì)90年代初，STR基因座首次作為一種重要的遺傳標(biāo)記在人類親權(quán)鑒定中被使用（Edwardsetal.,1992;Edwardsetal.1991）。
細(xì)胞STR分型（celllineSTRgenotyping）,是選用D19S433、D5S818、D21S11、D18S51、D6S1043、D3S1358、D13S317、D7S820、D16S539、CSF1PO、PentaD、vWA、D8S1179、TPOX、PentaE、TH01、D12S391、D2S1338和FGA等19個(gè)具有高度多態(tài)性基因座和一個(gè)性別基因位點(diǎn)Amelogenin對(duì)人源細(xì)胞進(jìn)行STR分型檢測(cè)。根據(jù)STR分型結(jié)果對(duì)細(xì)胞的生長(zhǎng)狀態(tài)（是否存在交叉污染）和細(xì)胞的株系進(jìn)行確認(rèn)的技術(shù)手段。
細(xì)胞STR分型的意義
科研成果能夠得到重復(fù)確認(rèn)，對(duì)于證實(shí)科學(xué)發(fā)現(xiàn)是十分重要的。如果數(shù)據(jù)無(wú)法重復(fù)，那么這個(gè)結(jié)果能否得到業(yè)界的認(rèn)可并為人所追隨就是個(gè)很大的疑問(wèn)了。很多生物醫(yī)藥的研究都采用培養(yǎng)細(xì)胞來(lái)進(jìn)行，這些細(xì)胞可能是從各大細(xì)胞庫(kù)得來(lái)，也可能是受贈(zèng)于其它研究人員。據(jù)估計(jì)，15-20%的時(shí)間里，實(shí)驗(yàn)中所使用的細(xì)胞已經(jīng)不是原來(lái)的細(xì)胞系，或者與其它細(xì)胞系發(fā)生了交叉污染(1-3)。ATCC以及其它細(xì)胞庫(kù)（CoriellInstituteforMedicalResearch,EuropeanCollectionofCellCultures(ECACC),DeutscheSammlungvonMikrorganismenandZellkulturen(DSMZ),JapaneseCollectionofResearchResources）都收到過(guò)提交的“錯(cuò)誤”的細(xì)胞系，盡管提交者把細(xì)胞系提交到上述機(jī)構(gòu)之前，還經(jīng)過(guò)了檢驗(yàn)。然而，最終證實(shí)這些細(xì)胞系還是鑒別錯(cuò)了(4,5)。此外，干細(xì)胞也可能被污染，作為干細(xì)胞賴以增殖的哺育細(xì)胞層，小鼠細(xì)胞很容易污染到干細(xì)胞中。顯然，細(xì)胞系遭到污染、特征鑒別錯(cuò)誤，將會(huì)極大地威脅著基于這些細(xì)胞而發(fā)表的論文的質(zhì)量和研究發(fā)現(xiàn)的正確性。為此，很多細(xì)胞庫(kù)現(xiàn)在都要對(duì)提交來(lái)的細(xì)胞系進(jìn)行STR分型檢測(cè)，并對(duì)細(xì)胞系之間的交叉污染進(jìn)行監(jiān)測(cè)。
細(xì)胞STR分型檢測(cè)方法
基于毛細(xì)管電泳檢測(cè)的STR分型檢測(cè)使用的是多重PCR復(fù)合擴(kuò)增系統(tǒng)，可以同時(shí)擴(kuò)增19個(gè)STR位點(diǎn)加1個(gè)性別決定位點(diǎn)Amelogenin，每個(gè)被分析的人源細(xì)胞系都有其獨(dú)特的DNA重復(fù)模式，因此通過(guò)與基礎(chǔ)圖譜進(jìn)行比對(duì)，即可對(duì)每一批新細(xì)胞系的種類進(jìn)行確認(rèn)。
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