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      北京鑒聯(lián)基因科技有限公司
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      細胞STR分型檢測

        行業(yè)動態(tài)     |      2022-05-09 20:28:17
       
        細胞STR分型介紹
       
        短串聯(lián)重復序列(shorttandemrepeat,STR)是核心序列為2-6個堿基的短串聯(lián)重復結構。20世紀90年代初,STR基因座首次作為一種重要的遺傳標記在人類親權鑒定中被使用(Edwardsetal.,1992;Edwardsetal.1991)。
       
        細胞STR分型(celllineSTRgenotyping),是選用D19S433、D5S818、D21S11、D18S51、D6S1043、D3S1358、D13S317、D7S820、D16S539、CSF1PO、PentaD、vWA、D8S1179、TPOX、PentaE、TH01、D12S391、D2S1338和FGA等19個具有高度多態(tài)性基因座和一個性別基因位點Amelogenin對人源細胞進行STR分型檢測。根據(jù)STR分型結果對細胞的生長狀態(tài)(是否存在交叉污染)和細胞的株系進行確認的技術手段。
       
        細胞STR分型的意義
       
        科研成果能夠得到重復確認,對于證實科學發(fā)現(xiàn)是十分重要的。如果數(shù)據(jù)無法重復,那么這個結果能否得到業(yè)界的認可并為人所追隨就是個很大的疑問了。很多生物醫(yī)藥的研究都采用培養(yǎng)細胞來進行,這些細胞可能是從各大細胞庫得來,也可能是受贈于其它研究人員。據(jù)估計,15-20%的時間里,實驗中所使用的細胞已經(jīng)不是原來的細胞系,或者與其它細胞系發(fā)生了交叉污染(1-3)。ATCC以及其它細胞庫(CoriellInstituteforMedicalResearch,EuropeanCollectionofCellCultures(ECACC),DeutscheSammlungvonMikrorganismenandZellkulturen(DSMZ),JapaneseCollectionofResearchResources)都收到過提交的“錯誤”的細胞系,盡管提交者把細胞系提交到上述機構之前,還經(jīng)過了檢驗。然而,最終證實這些細胞系還是鑒別錯了(4,5)。此外,干細胞也可能被污染,作為干細胞賴以增殖的哺育細胞層,小鼠細胞很容易污染到干細胞中。顯然,細胞系遭到污染、特征鑒別錯誤,將會極大地威脅著基于這些細胞而發(fā)表的論文的質量和研究發(fā)現(xiàn)的正確性。為此,很多細胞庫現(xiàn)在都要對提交來的細胞系進行STR分型檢測,并對細胞系之間的交叉污染進行監(jiān)測。
       
        細胞STR分型檢測方法
       
        基于毛細管電泳檢測的STR分型檢測使用的是多重PCR復合擴增系統(tǒng),可以同時擴增19個STR位點加1個性別決定位點Amelogenin,每個被分析的人源細胞系都有其獨特的DNA重復模式,因此通過與基礎圖譜進行比對,即可對每一批新細胞系的種類進行確認。
       
        參考文獻
       
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        5.MacLeod,R.A.F.etal.(1999)Int.J.Cancer83,555–63.
       
        6.Buehring,G.C.,Eby,E.A.andEby,M.J.(2004)InVitroCell.Dev.Biol.40,211–5.
       
        7.Liscovitch,M.andRavid,D.(2007)CancerLett.245,350–2.
       
        8.FDA.GeneralRequirementsforLaboratoryControls.21CFR
       
        211.160and21CFR610.18.
       
        9.ATCCConnectionNewsletter(2007)27,2–4.
       
        10.ATCCConnectionNewsletter(2000)21,1–2.
       
        11.Masters,J.R.etal.(2001)Proc.Natl.Acad.Sci.USA98,8012–7.
       
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